Molecular diversity of drug resistant mycobacterium tuberculosis strains in western Turkey
No Thumbnail Available
Date
2012
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Amaç: Bu çalışmanın amacı Türkiye’nin Batısında izole edilen ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis kökenlerinin moleküler çeşitliliğini ve klonal ilişkisini araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: 2006-2009 yılları arasında izole edilen sekizi rifampisine tek ilaç dirençli, 79’u çok ilaca dirençli olmak üzere toplam 87 köken IS6110 RFLP ve spoligotiplendirme yöntemleri ile incelenmiştir. Bulgular: Spoligotiplendirme sonuçlarına göre kökenlerin %7’si öksüz olarak tanımlanmış, %8’i ise SpoIDB4 veri tabanına göre tanımlanamayan ailelere ait bulunmuştur. Kökenlerin ait olduğu aileler LAM (%38), T (%35), Harlem (%7), Beijing (%2), S (%2) ve U (%1) olarak belirlenmiştir. Spoligotiplendirme sonuçlarına göre kümelenme oranı %75 olarak hesaplanmıştır. En baskın (%29) SIT kümesi SIT41’dir. IS6110 RFLP sonuçlarına göre 71 farklı IS6110 kalıbı izlenmiştir. Kökenlerin %26’sında kopya sayısı düşük bulunmuştur. Her iki yöntemin sonuçları birlikte değerlendirildiğinde kümelenme oranı %26 olarak bulunmuştur. Sonuçlar: Bölgemizde izole edilen ilaca dirençli tüberküloz basili kökenlerinin genotipik dağılımı çeşitlilik göstermektedir ve bölgemizde kümelenme oranı düşük bulunmuştur. Ancak ilaca dirençli kökenlerin kontrolü için daha kapsamlı ve uzun süren moleküler epidemiyolojik araştırmalara gereksinim vardır.